中国中医科学院望京医院建院于1997年1月，由原中国中医研究院骨伤科研究所、北京针灸骨伤学院附属医院和骨伤系合并组建。

医院占地面积78亩，建筑面积67870 m2，固定资产3.56亿元，编制床位1100张，开放床位688张。设有13个职能处室、32个临床科室、9个医技科室、20个病区、2个三级实验室、13个教研室。设有社区卫生服务站和120望京急救站。

医院现有职工1068人，其中：高级职称149 人，博士生导师13人，硕士生导师21人，北京中医药大学七年制本硕连读导师74人;医学博士42 人，医学硕士138 人;享受国务院政府津贴专家17人;国家级名老中医2 人，北京市名老中医 5 人;中国中医科学院首席研究员2人，学科带头人7人。

医院规划中的中医康复治疗中心48000 m2 、综合楼24000 m2，新大楼建成后，医院总建筑面积将达137705m2 ，能满足日门诊量8000人次、开放床位1100床的需求。

建院以来，承担各级课题260项，包括“863”计划、“973”专项、国家“十五”攻关计划、“十一五”科技支撑计划、中医药行业专项、国家自然科学基金等国家级课题83项;获得国家科学技术二等奖3项，省部级科研奖37项(其中北京市科学技术奖9项，国家中医药管理局科学技术奖1项，中华医学科技奖1项，中华中医药学会科学技术奖11项、著作奖10项，中国中西医结合学会科学技术奖5项)，其他科研奖22项;获国家专利19项，在核心期刊发表学术论文1168篇，主编出版著作116部。拥有中药药理(骨伤)和生物力学两个国家中医药管理局中医药科研三级实验室及国家中医药管理局筋伤治疗手法重点研究室。承办中国科技核心期刊《中国骨伤》。

所获荣誉有：国家中医管理局“中医骨伤科学重点学科、重点专科建设单位”; 国家中医管理局“全国中医骨伤科医疗中心”;国家中医药管理局“全国颈椎病重点专病建设单位”;国家中医药管理局“全国风湿病重点专病建设单位”; 国家中医药管理局“全国中医急诊临床基地建设单位”; 国家中医药管理局“全国肾病重点专科建设单位”; 国家临床重点专科(骨伤科)、(肾病科); 世界卫生组织传统医学合作中心; 全国针灸临床医疗中心北京分中心;京市医疗保险定点医院;医骨伤专业博士后流动站;国家中医临床教学基地和中医继续教育基地; 国家级一级刊物《中国骨伤》出版单位; 国家中医药管理局对外(国际)中医进修教育单位。

拥有FEP-BY02型高强度聚焦超声治疗系统(HIFU，海扶刀)、SR-1000Ⅱ肿瘤射频热疗机，Signa EXCITE 0.35T核磁共振仪、7800螺旋CT、CR-800系统、DR-7000直接数字化拍片系统、高频X线乳腺机、牙科全景机，以及多功能胃肠造影机等先进设备。