为了扩大医院服务范围，更为广州市海珠区及南海、番禺、顺德、中山等一带提供医疗方便，中山二院于2000年3月在海珠区瑞宝兴建 一所现代化综合性三级甲等医院，命名为“中山大学附属第二医院南院”(简称中山二院南院)。

　　南院为中山二院的延伸部分，其建院目标是：将南院创办成为以“肝胆外科”为特色的综合性医院。南院与总院为统一整体，资源共享;医疗技术队伍由本院派出的优秀专家和技术骨干组成。

　　南院于2002年1月正式开业，位于广州市海珠区东晓南路与盈丰路交界处，占地7000平方米，建筑面积26000平方米，另有4000平方米的大型停车场。医院大楼分前后二座，前座为综合门诊部，急诊室和综合内科、妇科肿瘤和妇科内分泌以及小儿外科住院部;后座为普通外科住院部，总病床超过300余张。门急诊开设有：急诊科、内科、外科、妇产科、儿科、皮肤科、中医科、神经内科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、康复科以及相关的辅助科室，即：手术室、检验科、放射科、 B超室、心电图、血库、中心注射室、挂号收费处和中、西药房等。各专科常规医疗设备配置齐全，完全满足临床常规检查的需要。

　　南院医疗业务运行由本院统一协调。南院门诊实行周一至周日全周开诊，急诊 24 小时倒班，配置救护车;中山二院总院定期派出副教授以上的专家到南院坐诊、查房、会诊;医院总部——南院之间开设往返巴士，如果在南院就医的患者遇到一些特殊检查须到中山二院总院检查，将由医院安排专车接送 到院总部接受检查 。因此在南院就诊将会享受到全方位的优质便利服务。

　　南院建设和装修广州一流，将以崭新的风藐为您提供全新的、现代化的、一流水平的医疗服务。中山二院南院全体医护人员向社会承诺：医术精湛、服务满意、收费合理。