广东省中医院二沙岛分院于1997年建成，位于风景如画的二沙岛上。二沙岛分院东靠珠江新城，北倚五羊新城，面临珠江，四面环水，树木成荫，绿草如茵，空气清新，真正人具有“绿、静、美”的环境，是治病康复的理想之所。
  二沙岛分院占地面积为40亩，绿化率为70%，为全国第一家具有岭南特色的园林式医院。医院布局呈“工”字形，分门诊楼、医技楼、住院楼、培训楼，内设有多功能国际会议厅、体检中心等，院内还设有网球场、游泳池、餐厅等，堪称现代化医院建筑的典范，与星海音乐厅、广东省美术馆等构成了一道亮丽的文化风景线。
  二沙岛分院开设心脏中心、ICU、消化内科、内分泌内科、泌尿外科、骨科、妇科等六个住院病区，住院病床250张，有内、外、骨、妇、儿、肛肠、皮肤、眼、耳鼻喉、针灸、按摩、理疗、口腔等科门诊和急诊室，日均门诊量1400余人次，并设有检验、放射科、功能检查、中西药房和手术室，年手术台次超过3000台次，拥有全自动化生化分析仪、螺旋CT、彩色B超、乳腺高频、经颅多谱勒等先进医疗设备。
  二沙岛分院严格执行省、市物价部门和公医办规定的收费标准，挂号、医疗、检验检查、药物等各种收费和大德路总院相同。双人病房有中央空调、独立洗手间（24小时热水供应）、衣柜、中心供氧、彩电、阳台等设施，每日床位费严格按照物价局规定的基本正常收费。另有套房，设有单人病房、会客厅、小餐厅和厨房、中央空调、独立洗手间（24小时热水供应）、彩电、阳台、电话、壁柜厨具、冰箱、微波炉等，由于设施齐备，床位费较双人房适当增加，但挂号、检查、治疗及药物各种收费没有提高。
  二沙岛分院按照医院领导提出的建设“一流技术、一流服务、一流设施”医院的要求，以及具有本院特色的医院文化的总方针指导下建设“精品”的二沙岛分院，近年来取得了令人瞩目的成绩。
  2000年10月29日，在二沙岛分院举行“全国名老中医临床经验学习班”。全国著名的老中医邓铁涛、任继学、路志正、干祖望、颜德馨、朱良春、张琪、陆广莘、周仲瑛、吉良晨等德高望重的教授参加了会议，并在花园里种下“名医树”。2001年4月20日在总院举行拜师十五位全国名中医仪式，医院30位青年中医骨干成为名中医的徒弟，开创了中医继承工作的创新模式，为医院中医人才队伍整体素质普遍提高打下了良好的基础。
  2000年6月1日，医院在二沙岛分院与美国加州大学合作成立广东加州心脏中心，引进世界最先进的心脏诊疗技术，在围手术期发挥中医的优势，开创国内中西医结合新的局面，在中医发展史上具有深远意义。中心进行的心脏手术中，包括冠状动脉搭桥手术和换瓣手术，年龄最小的一例只有两个月大，最大达86岁，最多搭桥6根，吸引了大量国内外病人慕名前来治疗，2003年1月9日，成功为美国著名棒球教练HAZEN实施了冠状动脉搭桥手术，被中央、省市多间新闻媒体报道，引起了较大的反响。
  2000年7月9日《羊城晚报》头版头条刊登了《术后退红包分文都不少》的新闻报道，报道了二沙岛分院妇二科高尚的医德医风。当晚，时任广东省委书记李长春同志作了“他们的经验很好，可会同卫生厅推广他们的经验，遏制行业不正之风”的重要批示，2001年8月31日卫生部、国务院纠风办、国家中医药管理局在广州召开了全国卫生行业作风建设现场会，与会领导和代表参观了二沙岛分院，同年11月12日，原中共中央政治局常委、国务院副总理李岚清到二沙岛分院视察并出席了汇报会议，称赞省中医院是“一间管理好、行风建设好的医院，且名符其实”。
  2003年3月正式开始数字化医院建设工作，并取得了成效，在此基础上，将进一步在全院铺开，为全院数字化管理打下了坚实的基础。
  2003年2月8日起，二沙岛分院急诊科接诊多例高危“非典”病人，护长叶欣带头冲锋在前，忘我工作，受到感染，在与“非典”的战斗中不幸地倒下了，终年46岁。她先后被中共中央组织部等评为全国优秀共产党员、五一劳动奖章获得者、革命烈士等光荣称号，并被国际授予“南丁格尔奖”。5月10、11、12日广东电台、广东电视台、广州电视台等连续在二沙分院组织了抗非典护士节的现场真播，蔡东士、李兰芳、雷于蓝、陈开枝等出席，并为叶欣护长塑像落揭幕。
  2003年8月6日，外二科在全院的支持和合作下，成功开展了肾移植手术，在中西医结合肾移植围手术期间治疗中取得了很好的疗效。该科的肾移植专科是我省唯一的中西医结合肾移植专科，不仅具备了现代医学肾移植的全部技术和特色，而且结合了中医中药的优势，形成了独具特色的中西医结合肾移植技术，运用到临床后取得了显著性的成果。与传统的肾移植技术相比，具有术后用药量少，恢复快，并发症少，肾功能长期稳定的特点，现医院还总结该项技术，使肾移植综合疗效达到一个新的台阶。
  建院以来，原中共中央政治局常委、国务院副总理李岚清，中共中央政治局常委、原广东省委书记李长春，中共中央政治局委员、广东省委书记，原全国政协副主席叶选平、全国人大副委员长李铁映，原卫生部长陈敏章、张文康，卫生部和国家中医药局领导殷大奎、朱庆生、马晓伟、佘靖，广东省委、省政府梁灵光、黄华华、卢瑞华、黄丽满、卢钟鹤、钟阳胜、蔡东士、汤炳权、李兰芳、陈开枝等领导先后到二沙分院视察指导。牙买加总督霍华德·库克，柬埔寨国会主席拉那列亲王，巴拿马第一副总统巴利亚里诺博士，古巴共产党中央政治局委员、中央国际关系部部长、国务委员何塞·拉蒙·巴拉格尔，塞舌尔副总统夫人，丹麦卫生大臣卡斯顿考克，著名人士、美国国际合作委员会主席陈香梅，世界卫生组织亚大地区韩相泰博士等先后本院参观，前来参观交流的还有美国、加拿大、日本、新加坡、澳大利亚、越南等多个国家以及国内各省、市和地区的医疗卫生单位领导和医务人员共3万多人次。
  二沙岛分院自建立不久，经常参与年所在辖区白云街社区以及与《南方日报》联合举办义诊服务。并经常性为社区服务（包括定期到所在区的广州市政协、星海音乐厅出诊），为社区的医疗服务作出了贡献。自1998年起，首先在各科主任及负责人开展的具有中医特色的《八段锦》早操学习，接着推广全院，同年7月1日起，每天在东花园向住院病人教授八段锦，受到病人欢迎。2002年4月份，分院在所在地区（共有200多的单位）的全社区运动会取得团体总分第6名的好成绩。2004年获“广州市无烟单位”称号。每年举行各30次的健康教育讲座和专科义诊，为广大群众提供了良好的健康服务。
  二沙岛分院全体员工牢记“仁爱、敬业、务实、进取”的医院精神，追求卓越，继续保持作为医院精品医疗服务的窗口，以精湛的技术和优质的服务，热诚地为来自世界各地的广大患者提供更好的医疗服务。