2004年苏州市政府为优化市属医疗资源，实施了苏州卫生史上规模最大的调整，原苏州市第二人民医院、市第三人民医院、市第四人民医院，三所有着50多年历史的市级综合医院，于2005年1月1日，合并建立苏州市立医院。

现已成为拥有3个综合性院区、3个市级诊疗中心、1个教学基地、1个司法鉴定所和4个社区卫生服务中心，2200余张床位的大型综合性医院。同时是南京医科大学附属医院和南医大研究生培养基地，卫生部全科医师规范化培训基地，江苏省母婴护理专科培训基地，年门急诊总量340万人次，出院病人8.9万人次，医疗服务总量省内领先。

现有苏州市母子医疗保健中心、市肿瘤诊疗中心和市卒中中心3个市级医疗中心，苏州市体检中心也设在我院。有超声科、消化科、产科3个省级重点专科，生殖遗传中心、骨科、妇产科、肿瘤科、心血管内科、新生儿科、影像科、重症医学科、检验科、烧伤整形科10个市级重点专科，以及超声、消化、临床检验3个市级质量控制中心。介入血管科、老年病科、肾内科、麻醉科、微创外科等也形成了专业特色。

苏州市母子医疗保健中心集省重点专科产科、市重点专科新生儿科和生殖遗传中心为一体，拥有华东地区规模最大的LDR家庭化产房、新生儿监护病房，设立了产科ICU，每年有1.4万个新生命出生，100多名羊水栓塞、重度子痫等危重孕妇和3500名危重新生儿得到救治，是苏州市及周边地区的危重孕妇救治中心和产前遗传疾病诊断中心，服务模式在国内领先。生殖中心开展了国内第三代试管婴儿技术。苏州市肿瘤诊疗中心形成了多科协作的规范化治疗模式，建立了南京医科大学肿瘤学博士生带教点和苏州市级肿瘤诊疗重点实验室，年收治肿瘤患者8000人次。卒中中心联合神经内外科和介入血管科，开展高难度脑外科微创介入手术、脑膜瘤切除术和顽固性癫痫根治手术。冠脉搭桥手术、心脏多瓣置换手术、动脉内膜剥脱术、单孔腹腔镜技术、宫腔镜技术、脊柱微创手术等均在市内领先。

医院始终以人才带科研，以科研促临床。由省“135”重点人才、省“333”工程培养对象、苏州市紧缺人才组成的高层次人才队伍，由40名全国专业委员会委员和省、市各专业委员会主委、副主委组成的学科带头人队伍，30多博导、硕导组成的教学师资队伍，引领了医院医教研的全面发展。建筑面积8000平方米、功能齐全的综合教学基地，承担了江苏省和苏州市的部分医师考核任务，建立了苏州市肿瘤诊断与治疗重点实验室，与复旦大学合作创办了苏州(复旦)生命科学联合实验室，连续获得国家、省自然基金课题和省新技术引进奖。

近年来，医院先后获得全国三八红旗集体、省卫生系统医疗服务先进单位、省群众满意的医疗机构、省卫生系统先进基层党组织、江苏省患者安全目标管理合格医院、江苏省平安医院、省卫生系统城乡对口支援工作先进集体、苏州市文明单位、省青年文明号、卫生部、省卫生厅优质护理示范工程优秀病区、苏州市平安医院创建示范单位等荣誉和表彰。

医院拥有双光子高能直线加速器、PET-CT、64排128层螺旋CT、ECT、1.5T核磁共振、大型平板DSA、DR等大批先进医疗设备，以及胶囊内镜、小肠镜、血管镜、TPS精确放疗系统、悬浮床、新生儿监护系统、遗传分析仪、胎儿多普勒等先进专科设备。